环境监管能力建设工程：包括全省环境监察能力建设、环境监测能力建设、环境信息能力建设、环境宣传教育能力建设、辐射监管能力建设、省科研监测和环境应急指挥中心建设等六大部分，投资8.15亿元。

　　危险废物和医疗废物处置工程：建设合肥、铜陵、马鞍山3座危险废物集中处置中心(规模10.5万吨/年)、13座医疗废物集中处置设施(规模为2.2万吨/年)和省固体废物管理中心，投资5.17亿元。

　　城市污水处理工程：建设68个市、县城市污水处理厂及其配套管网、中水利用和污泥处置项目，处理规模163.5万吨/日，投资43.45亿元。

　　城市垃圾处理工程：建设31个城市(包括县城)垃圾处理厂和35个生活垃圾焚烧热电厂，处理规模7750吨/日，投资21.37亿元。

　　重点工业污染源治理工程：主要包括燃煤电厂脱硫、清洁生产与循环经济、污染综合治理等104个项目，投资125.46亿元。

　　生态功能区建设工程：建设沿淮调蓄洪区国家级重要生态功能区和皖西大别山水库上游水源涵养与森林保护重要生态功能区、新安江上游水源涵养重要生态功能区、皖东南江河源头区重要生态功能区，3个省级重要生态功能保护区，投资5.6亿元。

　　农村小康环保工程：实施以农村环境综合整治、农村废弃物综合利用、污染土壤生态修复、小城镇环保基础设施建设、农业循环经济等为主要内容的农村小康环保行动计划，投资18.35亿元。

　　自然保护区能力建设和生态恢复工程：主要包括综合科学考察、建立资源档案、重点保护野生动植物资源调查、人员培训、保护区基础设施与监管能力建设等；抢建一批代表各类生态系统的自然保护区，重点提高和完善鹞落坪、扬子鳄、牯牛降、升金湖、天马、铜陵淡水豚等6个国家级自然保护区的管护能力，新建一批自然保护区。对矿山开发引起的生态破坏进行生态恢复或重建，投资5.45亿元。

　　城市环境综合整治工程：对重点城市水环境、大气环境和声环境进行综合治理，投资23.98亿元。

　　饮用水安全保障工程：开展城市饮用水源地保护及农村饮用水安全保障项目建设，投资3.98亿元。